Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Cab39Q06138 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms