Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm19640-201ENSMUST00000214849 464 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Top2aQ01320 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms