Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Olfr1230-201ENSMUST00000099787 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Grin2bQ01097 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Grin2bQ01097 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms