Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC8.71□□□□□ -1.01
PrcdQ00LT2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
PrcdQ00LT2 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms