Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Rpl30P62889 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Rpl30P62889 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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