Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Rgs3-205ENSMUST00000107424 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Rab3cP62823 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Rab3cP62823 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms