Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp46P62069 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Usp46P62069 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm4265-201ENSMUST00000206701 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 AC154252.1-201ENSMUST00000226041 473 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Usp46P62069 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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