Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Usp25P57080 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms