Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
PctpP53808 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
PctpP53808 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
PctpP53808 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms