Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Fgd1P52734 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Fgd1P52734 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms