Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm23153-201ENSMUST00000175323 313 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm37604-201ENSMUST00000191749 1272 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 AC165260.5-201ENSMUST00000224640 1247 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 CT009713.1-201ENSMUST00000224828 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 0610040B10Rik-203ENSMUST00000198455 1643 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm14659-201ENSMUST00000117667 843 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LtbrP50284 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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