Protein–RNA interactions for Protein: P46935

Nedd4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 887 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd4P46935 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm18204-201ENSMUST00000209835 793 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Nedd4P46935 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Nedd4P46935 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nedd4P46935 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nedd4P46935 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Nedd4P46935 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Gm3318-201ENSMUST00000217604 1183 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Nedd4P46935 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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