Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Lig1P37913 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lig1P37913 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lig1P37913 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Lig1P37913 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Lig1P37913 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms