Protein–RNA interactions for Protein: P35278

Rab5c, Ras-related protein Rab-5C, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5cP35278 Zfp114-203ENSMUST00000206547 3154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rab5cP35278 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rab5cP35278 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rab5cP35278 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rab5cP35278 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rab5cP35278 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rab5cP35278 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Rab5cP35278 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rab5cP35278 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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Rab5cP35278 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Rab5cP35278 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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