Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RxraP28700 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
RxraP28700 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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