Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TP20293 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
TP20293 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
TP20293 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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