Protein–RNA interactions for Protein: J3QM72

Gm20834, Predicted gene, 20834, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20834J3QM72 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm20834J3QM72 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm20834J3QM72 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm20834J3QM72 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm20834J3QM72 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm20834J3QM72 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms