Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Gm21411J3KMS0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm21411J3KMS0 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms