Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Cldn20G5E8X0 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Cldn20G5E8X0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
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