Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Taf4E9QAP7 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Taf4E9QAP7 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Taf4E9QAP7 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms