Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Syde2E9PUP1 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms