Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Rdh8D3Z6W3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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