Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 AC129336.1-201ENSMUST00000220224 2277 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Gm3543D3Z235 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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