Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm17333C6EQI3 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gm17333C6EQI3 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm17333C6EQI3 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm17333C6EQI3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm17333C6EQI3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm17333C6EQI3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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