Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Usf3B2RUQ2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms