Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Odf2A3KGV1 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Odf2A3KGV1 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms