Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ77

Prdm12, PR domain zinc finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm12A2AJ77 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prdm12A2AJ77 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms