Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm3550W4VSN7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm3550W4VSN7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
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