Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Krt27Q9Z320 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms