Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hdac6Q9Z2V5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Hdac6Q9Z2V5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hdac6Q9Z2V5 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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