Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn9Q9Z0S7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn9Q9Z0S7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn9Q9Z0S7 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn9Q9Z0S7 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cldn9Q9Z0S7 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn9Q9Z0S7 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn9Q9Z0S7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn9Q9Z0S7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn9Q9Z0S7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cldn9Q9Z0S7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cldn9Q9Z0S7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms