Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Phtf1Q9QZ09 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Phtf1Q9QZ09 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Phtf1Q9QZ09 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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Phtf1Q9QZ09 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Phtf1Q9QZ09 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Phtf1Q9QZ09 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Phtf1Q9QZ09 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Phtf1Q9QZ09 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Phtf1Q9QZ09 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Phtf1Q9QZ09 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Phtf1Q9QZ09 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phtf1Q9QZ09 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phtf1Q9QZ09 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Phtf1Q9QZ09 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phtf1Q9QZ09 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
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Phtf1Q9QZ09 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms