Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Tomm40Q9QYA2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms