Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Slc1a2-202ENSMUST00000080210 11595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Ube3a-203ENSMUST00000200758 9856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Kcnip3Q9QXT8 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Kcnip3Q9QXT8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 450.2 ms