Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Ccl28Q9JIL2 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms