Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Cdk19os-201ENSMUST00000044774 534 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Prss51-201ENSMUST00000063785 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Rtbdn-202ENSMUST00000109740 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms