Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERP3

Trim54, Tripartite motif-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim54Q9ERP3 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trim54Q9ERP3 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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