Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Riok3Q9DBU3 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm12158-201ENSMUST00000130493 631 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm20738-201ENSMUST00000177666 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 5730420D15Rik-201ENSMUST00000181781 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm20816-202ENSMUST00000187846 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm43390-201ENSMUST00000196614 421 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm6579-201ENSMUST00000208224 865 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 AC172194.1-201ENSMUST00000214246 1020 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 CT030645.3-201ENSMUST00000225483 1022 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 CT573085.2-201ENSMUST00000226097 552 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 AC144628.1-201ENSMUST00000227943 466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Olfr380-201ENSMUST00000075532 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm45475-201ENSMUST00000209381 309 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 4930434F21Rik-201ENSMUST00000214381 742 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Riok3Q9DBU3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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