Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
SrpraQ9DBG7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SrpraQ9DBG7 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms