Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pop5Q9DB28 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms