Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rep15Q9D7T1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Rep15Q9D7T1 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Rep15Q9D7T1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rep15Q9D7T1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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Rep15Q9D7T1 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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