Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Mpv17-206ENSMUST00000201353 846 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm13271-201ENSMUST00000094992 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Rpl10-ps1-201ENSMUST00000119438 645 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Capns2Q9D7J7 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms