Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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PrameQ9D4Z5 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PrameQ9D4Z5 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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