Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Zbed3Q9D0L1 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Zbed3Q9D0L1 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms