Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nip7Q9CXK8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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