Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Utp23Q9CX11 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms