Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rprd1bQ9CSU0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Rprd1bQ9CSU0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms