Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nudcd2Q9CQ48 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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