Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Mrpl27Q99N92 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Mrpl27Q99N92 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms