Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Smg8Q8VE18 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Smg8Q8VE18 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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